曾在澳大利亚新南威尔士大学做访问学者和英国贝尔法斯特女王大学做访问教授。兼任湖北省青年科技工作者协会副会长、国家自然科学基金项目评阅专家、湖北省自然科学基金项目评审委员会委员、欧盟ERA-IB工业生物技术项目受邀评审专家，Biomacromolecules, Eur J Biochem等多种国际重要学术期刊的审稿专家。

主要研究方向为生物质废弃物资源的高值化利用。已主持3项国家自然科学基金资助项目、3项湖北省自然科学基金资助项目（杰出青年人才项目1项）、1项中国博士后科学基金资助项目、1项国家回国人员科研启动基金资助项目、1项湖北省科技攻关项目。其主持的“壳聚糖生物活性的构效关系研究”项目2003年被列为首批湖北省教育厅优秀中青年科技创新团队资助计划项目。已在Food Chem,高等学校化学学报等国内外学术期刊上发表论文110余篇，SCI 收录论文40多篇，EI收录论文20多篇，发表的第一作者论文已被SCI论文引用近千次，单篇被引达超100次的有3篇；已获20项发明专利授权；获得湖北省自然科学奖一等奖（湖北省人民政府），北京市科学技术奖二等奖（北京市人民政府），湖北省普通高等学校优秀教学成果二等奖（湖北省人民政府），孝感市科学技术奖一等奖和二等奖（孝感市人民政府）。

加拿大学院委员会统计分析认为覃彩芹教授是其所从事研究领域中全球影响力排名前1%的学者。

孝感市首届十大杰出青年（1996年）、湖北省高校学术骨干（1996年）、湖北省百名跨世纪优秀青年人才（1996年）、湖北省有突出贡献的中青年专家（1997年）、武汉大学优秀毕业研究生（2002年）、第五届湖北省优秀博士学位论文奖（2003年）、第六届湖北省青年科技奖（2003年）、国务院政府特殊津贴（2006年）、武汉大学优秀博士后（2008年）、孝感市专业技术人才“121”培养计划培养对象（第一类）（2009年），湖北省新世纪高层次人才工程（第一层次）人选（2011年）。